2010-02-20から1日間の記事一覧

ジェノタイプデータのPCA eigen()

集団構造化があるときに、PCAして、プロットすることがある。 その情報を使って、形質マッピング検定に用いる前座のようなもの。 この論文がEigenstratのそれですが。 ここでやっている、PCA部分をRでなぞってみます #構造化集団をシミュレート Nm<-1000 #マ…

RでSNPデータのPCAプロット eigen()