2011-12-19から1日間の記事一覧
The pleiotropic structure of the genotype–phenotype map: the evolvability of complex organisms. Günter P. Wagner & Jianzhi Zhang,p204 | doi:10.1038/nrg2949
５月号は遺伝子治療特集 ４月号は幹細胞特集
Genotype and SNP calling from next-generation sequencing data. Rasmus Nielsen, Joshua S. Paul, Anders Albrechtsen & Yun S. Song,p443 | doi:10.1038/nrg2986 次世代シークエンサー ジェノタイピング・ソフトウェア SOAP2->SOAP3 realSFS Samtools GA…
次世代forトランスクリプトームのアセンブルについては2011 Octでも Next-generation transcriptome assembly. Jeffrey A. Martin & Zhong Wang,p671 | doi:10.1038/nrg3068
Using electronic health records to drive discovery in disease genomics. Isaac S. Kohane, p417 | doi:10.1038/nrg2999 EHR-driven genomic research(EDGR) Electronic health record(EHR) 支える資源や技術 Biorepositories Natural language processin…
Epigenome-wide association studies for common human diseases. Vardhman K. Rakyan, Thomas A. Down, David J. Balding & Stephan Beck, p529 | doi:10.1038/nrg3000 DNAメチル化状態の分類 MVP:Methylation variable position DMR:Differentially methla…
New approaches to disease mapping in admixed populations. Michael F. Seldin, Bogdan Pasaniuc & Alkes L. Price,p523 | doi:10.1038/nrg3002 Local Ancestry: 染色体の部分ごとに、異なる祖先に紐づいているとみなす(Ancestry-informative markers) ANC…
結果のインパクト Assessing and managing risk when sharing aggregate genetic variant data. David W. Craig, Robert M. Goor, Zhenyuan Wang, Justin Paschall, Jim Ostell, Michael Feolo, Stephen T. Sherry & Teri A. Manolio,p730 | doi:10.1038/nrg…
Understanding the contribution of synonymous mutations to human disease.Zuben E. Sauna & Chava Kimchi-Sarfaty,p683 | doi:10.1038/nrg3051 影響の出し方 スプライシング RNAの立体構造 翻訳効率 RSCU(Relative Synonymous Codon Usage)を含む その他 …
Variation in the mutation rate across mammalian genomes.Alan Hodgkinson & Adam Eyre-Walker,p756 | doi:10.1038/nrg3098 変異の入りやすさを、大小スケール別に考える(変異が入る塩基のタイプは、塩基が入る場所の隣の塩基は、少し範囲を広げて、もっと…
Non-coding RNAs in human disease.Manel Esteller,p861 | doi:10.1038/nrg3074 種類 Short ncRNAs miRNAs:19-24bp >1424個以上(ヒト) piRNAs:26-31bp 23,439個 tiRNAs:17-18bp >5,000個 Mid-size ncRNAs snoRNAs:60-300bp >300個 PASRs:22-200bp >10,000個 …
Genetic contributions to behavioural diversity at the gene–environment interface.Andres Bendesky & Cornelia I. Bargmann,p809 | doi:10.1038/nrg3065 行動様式という表現型 行動は外界からの刺激を受けて起きる〜知覚・感覚・受容体に関する遺伝因子…
Experimental and analytical tools for studying the human microbiome.Justin Kuczynski, Christian L. Lauber, William A. Walters, Laura Wegener Parfrey, José C. Clemente, Dirk Gevers & Rob Knight,p47 | doi:10.1038/nrg3129 Microbiomeに次世代シ…
Repetitive DNA and next-generation sequencing: computational challenges and solutions.Todd J. Treangen & Steven L. Salzberg,p36 | doi:10.1038/nrg3117 次世代シークエンサー：ゲノムリードのアラインメント・アセンブリ SV/CNV detection BreakDanc…
Emerging biomedical applications of synthetic biology. Wilfried Weber & Martin Fussenegger,p21 | doi:10.1038/nrg3094 Synthetic biology(合成生物学)の医学応用。合成ゲノム、人工発現制御系、ワクチン、薬の探索、微生物による薬の合成コントロール…
年末恒例のぱらぱら総説を眺めるシリーズ Nature reviews genetics 2012 Janからさかのぼって、2011 Janまで
