FACS

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こちらでフローサイトメトリーデータの木構造・クラスタリング・視覚化の話を書いた マルチマーカー・フローサイトメトリーで血球の分化を木構造化するはなし 一般に免疫学で血球をフローサイトメトリー解析するときには、n種のマーカーの発現パターンをバイ…

1細胞ゲノム解析

総説 「1細胞ゲノム解析」の手法の特徴を決める尺度 細胞をより分ける方法 処理細胞の数 解析対象となる遺伝子の数 検出に用いる技術 対象となる細胞・組織・条件 色々な手法 FISH(mRNA fluorescent in situ hybridization) 処理細胞数:100 遺伝子数:3-4 技…

多次元FACS自動コール

フローサイトメーターデータの解析概説(こちら) 生データ→データの質チェック→正規化→外れ値の除去→自動ゲーティング→クラスター→ラベル付け→特徴抽出→解釈 既存の方法の分類 分類するための尺度 外れ値除去法 分布利用 距離利用 自動ゲーティング法 Supervi…