IsoGene

Isotonic regression, Pool-Adjacent-Violators Algorithm (PAVA)

こちらの記事でIsoGenenによる容量反応曲線解析について書いた このパッケージでの回帰はfortranのpavaを使っているという Rにはisotoneパッケージもある pava: pool-adjacent-violators algorithmはisotonic regressionの一つという それぞれの資料はこちら…

用量反応を大規模に

こちらの続き:用量反応を見るとする こちらにIsoGeneというRのパッケージの論文がある マイクロアレイのデータで、薬を振りかけて、用量依存に発現量が動くかどうかを大規模・マルチプルテスティングの枠組みで調べよう、いくつかの統計量があるから、ひと…