fMRI

RでfMRI

paper fMRIのための各種ソフトウェア MATLABのSPMを筆頭にFSL,MIPAV,AFNI,FreeSurfer,ANTS RのパッケージとしてAnalzeFMRI,oro.nifti,oro.dicom,fmri,neuRosim,arf3DS4,RNiftyReg,brainwaver,tractor.base,https://cran.r-project.org/web/packages/waveslim…

4d data ROI(Region of interest)-analysis scipy.ndimageはarbitrary dimension arrayの画像処理をするモジュール 基本処理としてはフィルタとか(こちら) numpyのアレイの作りに関する記事 numpy.arrayの演算の速さに関する記事(コピーする操作としない操作…

4D(3D+time1D)データ

4DデータはfMRIで進んでいる 例えば、Analysis of fMRI Timeseries(PDF)とか それに関してPythonはPyMVPAがExamplesを提供している ちなみにPyMVPAはMultivariate Pattern Analysis in Pythonのこと fMRIはランダムフィールドを使うのだけれど、そんなことを…