Population subdivision と (FST), AMOVA
清書版
- Fixation indexとの計算・検証のためのエクセルファイルはこちら(作成:京都大学医学研究科附属ゲノム医学センター、協力:理化学研究所遺伝子多型研究センター関節リウマチ関連遺伝子研究チーム、使用にあたっては、こちらに準ずる)
Population subdivisionとは、観測集団が遺伝的に均一でないことを言う。また、均一でない具合についてを言う。
Population subdivisionの存在・程度・構造を観測データから推定するためには、観測データが、均一集団を代表しているという仮定からのずれの度合いを調べることによってなされる。
他の推定・仮説検定と同じく、Population subdivisionの解析も、subdivisionの程度・構造の推定と、subdivisionの存在の検定(均一であるという帰無仮説の棄却)とからなる。
また、着目する指標により、解析手法は異なる名称で呼ばれる。
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