6 Epistasis



  • caes controlの対比で調べるか、caseでのみ調べるかのいずれか
  • All pairwise combinations of SNPs
  • 100K markers x 500 samples dataset についての4.5 billion combinationsで24時間強
  • 手法はOdds Z score for test of odds ratioを漸近近似でP化している、とのことだが、出典が見つけられない・・・