SNP パワー

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High risk allele frequency (A) : (0 - 1) リスクアレル頻度
Prevalence : (0.0001 - 0.9999)  疾患の集団中有病率
Genotype relative risk Aa : ( >1 )  ヘテロのRR
Genotype relative risk AA : ( >1 )  ホモのRR(>1とありますが、1を入れて、リスクなし、ともできます)

D-prime : (0 - 1) RRを想定しているSNPと、タイピングするSNPとのペアワイズLDのD’
Marker allele frequency (B) : (0 - 1) タイピングする方のSNPのアレル頻度

Number of cases : (0 - 10000000) ケースの人数
Control : case ratio : ( >0 ) 2なら、コントロールはケースの2倍で200人
( 1 = equal number of cases
and controls)

Unselected controls? (* see below)
健常コントロールの場合はチェックを外す、疾患者を含むかもしれない一般集団のときは、チェックを入れる


User-defined type I error rate : (0.00000001 - 0.5) P値
User-defined power: determine N : (0 - 1) パワー
(1 - type II error rate)