2008-12-14 ハプロタイプ間の距離のこと、ハプロタイプがある状態から離れる過程のこと メモ 2008年メモ ハプロタイプ 距離 アレル共有距離(Allele sharing distance)というのがある。これは、すべてのハプロタイプの差異が変異によるとみなしたときに適当な距離の定義である。種間距離を測るときなどは、これが適当である。全座位が異なるハプロタイプ同士の距離が最大となる。 組み換えを考慮するとき、全座位が異なるハプロタイプ同士は、組み換えを適当に起こすことで、すべてのハプロタイプを生成する種となることができる。 座位数kにつき、そのように全座位が異なるハプロタイプのペア数はある。 自由度もが適当?