long non-coding RNA

  • 文献:Long non-coding RNAs: insights into functions. TR Mercer et al. nat reviews genet 10:155-159 2009
  • "RNA world"という仮説
    • DNAに遺伝情報の伝達を担わせるより以前に、生物はRNAによって生き、遺伝情報を伝えていたとする仮説
    • 情報保存はより安定なDANに譲り、触媒機能はタンパクに譲り、そのブリッジの役割としてRNAがある、という仮説
  • long ncRNAは、仮の定義として200ヌクレオチド超と言えるか・・・
  • long ncRNAは、タンパクをコードしないものと考えてよい
  • ncRNAはcoding RNAの少なくとも4倍超の転写をされるらしい
  • long ncRNAの位置はcoding RNAや短いncRNAの位置と重なったり相互に互い違いに(interspersed)なったりして、複雑
  • 本当に複雑
    • trans-spliced transcripts:?
    • macroRNAs:genome上の非常に長距離を超えて作られる
    • multigene transcripts: 複数の遺伝子を超えて作られる、とか、染色体を超えて作られたり・・・
  • 発生初期に特に実在・機能性重要な例があるようだ
    • まだ定見とは言い難い
  • long ncRNAの機能
    • 近傍のcoding genesをtrans形式で発現制御する???
    • epigenetic changesを介する??(Chromatin modifying complexesのリクルート)
    • 転写調節??
      • Proximal promoterからlong ncRNAができて、それがRNA-binding タンパクを呼び込んで転写に関わらせる??
      • 転写活性複合体のコファクタとして働く??
      • 転写活性を持つマシナリ複合体の調整作用を持つ??
      • プロモータ選択に関わることでRNAポリメラーゼの活性を調節する??
      • Post-transcriptional調節??
        • 核酸高分子として、相補鎖配列を認識できることから、転写物の転写後調節を、配列特異的に行うことができる??