ぱらぱらめくる『バイオインフォマティクス』〜バイオインフォマティクスの教科書の目次を眺めてみるだけ〜

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バイオインフォマティクス

バイオインフォマティクス

  • 第1章 はじめに
  • 第I部 数理的および計算的手法
    • 第2章 確率と統計
    • 第3章 コンピュータ科学のアルゴリズム
    • 第4章 パターン解析
    • 第5章 最適化
  • 第II部 応用
    • 第6章 配列アラインメント
    • 第7章 分子系統学
    • 第8章 ゲノミクス
    • 第9章 プロテオミクス
    • 第10章 RNA
    • 第11章 DNAマイクロアレイ
    • 第12章 生物情報データベースとインターネット資源
  • 第1章 はじめに
  • 第2章 確率と統計
  • 第3章 コンピュータ科学のアルゴリズム
    • アルゴリズム
    • ソートとクイックソート
    • 文字列検索、高速検索
    • 文字列のための索引構造、検索トライ、接尾辞木
    • バローズ-ホイラー変換
    • ハッシング(ハッシュ)
  • 第4章 パターン解析
  • 第5章 最適化
  • 第6章 配列アラインメント
    • 可能なアラインメントの数
    • ドットマトリックス
    • 一致と不一致へのスコアリング
    • スコア関数の開発
    • 動的計画法を用いた配列アラインメント
    • データベースに対する配列アラインメント
    • 多重配列アラインメント法
  • 第7章 分子系統学
  • 第8章 ゲノミクス
  • 第9章 プロテオミクス
    • タンパク質構造
    • アミノ酸配列とタンパク質構造の実験的決定
    • 分子構造モデリングのコンピュータ科学的手法
    • コンピュータによるタンパク質の構造と機能予測
  • 第10章 RNA
    • RNAワールド仮説
    • RNAの機能
    • 逆転やによるRNA鎖配列決定
    • ノーザンブロット
    • RNAの一次構造
    • RNAの二次構造
    • RNAの三次構造
    • RNA二次構造のコンピュータによる予測
    • 配列比較解析によるRNA構造予測
  • 第11章 DNAマイクロアレイ
    • DNAマイクロアレイの設計
    • 結合仮定の速度論
    • データの前処理と規格化
    • 遺伝子発現プロファイルの統計
    • クラス予測とクラス発見
    • 次元の削減
    • クラス発見
    • クラス予測、特異的発現を示す遺伝子
    • 多重検定と偽発見率(FDR)解析
    • Gene Ontologyデータベース
  • 第12章 生物情報データベースとインターネット資源
    • ゲノムデータベース
    • タンパク質データベース
    • RNAデータベース
    • 遺伝子発現データベース
    • オントロジー・データベース
    • 遺伝子・タンパク質のパスウェイ・データベース
    • プログラムとサービス
    • 医学データベース