ぱらぱらめくる『Nature Reviews Genetics 2011』2 次世代シークエンサー
- Repetitive DNA and next-generation sequencing: computational challenges and solutions.Todd J. Treangen & Steven L. Salzberg,p36 | doi:10.1038/nrg3117
- 次世代シークエンサー:ゲノムリードのアラインメント・アセンブリ
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- SV/CNV detection
- BreakDancer
- CNVnator
- He et al.
- PEMer
- VariatonHunter
- SNP detection
- Short-read alignment
- De novo assembly
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- 次世代シークエンサー:トランスクリプトーム解析のツール
- Spliced read alignment
- Reference-guided transcript assembly
- De novo transcript assembly