Cis-regulatory elements

• Cis-regulatory elements: molecular mechanisms and evolutionary processes underlying divergence
• CTCF: Master Weaver of the Genome(Insulator)
• cisとtransのregulatory elements
  • cis: DNA分子として連続していることをもって影響するもの
  • trans: タンパク質・RNA分子など分子の移動・拡散を介して影響するもの
• cis-regulatory elements
  • Promoters
    • 転写開始点近傍
    • alternative promoters
  • Cis-regulatory_module
    • Promoterを含む転写開始点から100-1000bp程度までの上流域
  • Silencer
    • Repressor結合領域
  • Enhancers
    • 近傍：5'側上流、3'側下流、イントロン
    • 遠位(1000-2000 kbも：Long-Range Control of Gene Expression: Emerging Mechanisms and Disruption in Disease
  • Insulator(insulate:覆う、絶縁する)
    • context-dependent promoter activation/repression, enhancer blocking and/or barrier insulation, hormone-responsive silencing, genomic imprinting, and, long-range chromatin interactions

(Wikipediaより)