Threads :駆け足でサーフする『ENCODE explorer (nature)』

  • ENCODE explorerでは多数の解析・論文をThreadsと呼ぶものでトピック別に再編しなおしている
    • 複数の論文が転写因子について書いていて、個々の論文では転写因子に関する記載が論文の中の一部である、というようになっている
    • これだと、「転写因子」について網羅的に読みたい、と思うと、複数の論文から抽出して来て読みあわせる必要が出る
    • Explorerでは「転写因子」について論文横断的に抽出しひとまとめにして提示する
  • 現時点でのThreadsリスト(こちら)
    • 01 Transcription factor motifs
    • 02 Chromatin patterns at transcription factor binding sites
    • 03 Characterization of intergenic regions and gene definition
    • 04 RNA and chromatin modification patterns aournd promoters
    • 05 Rpigenetic regulation of RNA processing
    • 06 Non-coding RNA characterization
    • 07 DNA methylation
    • 08 Enhancer discovery and characterization
    • 09 Three-dimensional connections across the genome
    • 10 Characterization of network topology
    • 11 Machine learning approaches to genomics
    • 12 Impact of functional information on understanding variation
    • 13 Impact of evolutionary selection on functional regions