2008-12-12から1日間の記事一覧

ハプロタイプ配列を比べる、ディプロタイプ配列を比べる

ハプロタイプ配列の比較 2染色体の配列が得られたとする。 同一か異なるかを座位ごとに比べることができる 同一か異なるかがどのように連結しているかを場合わけすることができる その連結具合の場合わけがどのような分布をするかがゲノムワイドで特徴を持…

カタラン数

カタラン数の規則をそのまま使って、組み換えなしの配列変遷を抽象的に捉える カタラン数の規則を(たぶん)若干改変・拡張して、組み換えありの配列変遷を抽象的に捉える PDFリンク 日記内リンク

高次元立方体分割表の自由度

カテゴリ数nで次元数kの高次元立方体分割表にて、k次元別に観測がなされたとする。そのときの自由度は

一般化平均の定義式と生起確率

一般化平均: 最小値: 調和平均: 幾何平均: 算術平均: 二乗平均: 最大値: さらに一般化して一般化f平均 ある事象が確率pでおきるとき、その事象が繰り返し起きる確率は。一般化平均のいくつかの排反事象があるときに同一事象が繰り返し起きるときの確率の部分…

Hardy-Weinberg不平衡と連鎖不平衡の混合状態の捕捉

ディプロタイプとして、同居したハプロタイプ2本のヘテロ座位の間に組み換えが発生しうる。 組み換えは、遺伝的距離(物理的距離と組み換え率)が定める。 ディプロタイプとして、異なるハプロタイプ2本が同居するかどうかをHWDが定める。

モジホコリの迷路探索

真正粘菌変形体の時空バターン形成−振動と流動から細胞行動へ− パルス結合振動子モデルにおける進行波状態を応用したセンサネットワークのための自己組織型通信機構 解析的な解と、生物学的な解 一般的な意味での解析的な解は、「直観的」に得られたゴール …

2008年

2008年にブログに書いたり書かなかったりした事柄で、年越しを前に、机の上にはそれに関して整理のつかない走り書きが乱雑に積まれている。毎年のこと。来年につながるにしろつなげるにしろ、そうならないにしろ、そうしないにしろ、項目をリストにすること…