教科書

ヒトの染色体DNAの統計 駆け足で読む『Quick Reference』of 『Human Molecular Gentics』

染色体 全長(Mb) ユークロマチン(Mb) ヘテロクロマチン(Mb) 1 249 224 19.5 2 243 240 2.9 3 198 197 1.5 4 191 188 3.0 5 181 178 0.3 6 171 168 2.3 7 159 156 4.6 8 146 143 2.2 9 141 120 18.0 10 136 133 2.5 11 135 131 4.3 12 134 131 4.3 13 115 96.…

ヒトのゲノムと遺伝子の統計 駆け足で読む『Quick Reference』of 『Human Molecular Gentics』

ヒトゲノム構成要素の大きさ ミトコンドリアゲノム 16.6kb 核ゲノム 3.1Gb ユークロマチン部分 2.9Gb(〜93%) 高度に保存された部分 〜150Mb(〜5%) タンパク質コード部分 〜35Mb(〜1.1%) その他の高度に保存された部分 〜115Mb(〜3.9%) 重複セグメント 〜160M…

組織の由来胚葉 駆け足で読む『Quick Reference』of 『Human Molecular Gentics』

3種 Embryonic ectoderm Embryonic mesoderm Embryonic endoderm Embryonic ectoderm Epidermis skin,hair,mammary gland Epidermal placodes lens,inner ear Neural tube brain,spinal cord,terina Neural crest paripheral nervous system,melanocytes,so…

胚体外膜(Extraembryonic membranes) 駆け足で読む『Quick Reference』of 『Human Molecular Gentics』

卵黄嚢 Yolk sac 羊膜 Amnion 絨毛膜 Chorion 尿膜 Allantois 胎盤 Placenta

免疫系細胞の分類 駆け足で読む『Quick Reference』of 『Human Molecular Gentics』

リンパ球系 B Naive B Plasma B Memory B T Helper T Cytotoxic T Regulatory T(Treg,supT) Memory T NKT T NK 非リンパ球系 Mononuclear phagocyte Monocytes Motile macrophages Tissue-specific macrophages Dendritic cells Langerhans cells Interstiti…

英語で

日本語を母語としない学生向けの教科書としたら(案) (1) Genetics and statistics. (2) Computer skills and math. For (1): Human Molecular Genetics作者: Tom Strachan,Andrew Read出版社/メーカー: Garland Science発売日: 2010/04/22メディア: ペーパー…

ぱらぱらめくる『Algebraic Geometry and Statistical Learning Theory』

こちらから続く Algebraic Geometry and Statistical Learning Theory (Cambridge Monographs on Applied and Computational Mathematics)作者: Sumio Watanabe出版社/メーカー: Cambridge University Press発売日: 2009/08/13メディア: ハードカバー クリッ…

ぱらぱらめくる『Lectures on Algebrainc Statistics』

こちらから続く Lectures on Algebraic Statistics (Oberwolfach Seminars)作者: Mathias Drton,Bernd Sturmfels,Seth Sullivant出版社/メーカー: Birkhauser Basel発売日: 2008/12/10メディア: ペーパーバック クリック: 18回この商品を含むブログ (2件) を…

ぱらぱらめくる『計算統計入門・代数生物学』

こちらから 計算統計入門 代数生物学―大規模・高精度計算が拓いた新技法 (現代技術への数学入門)作者: 吉田寛,手塚集,若山正人出版社/メーカー: 講談社発売日: 2008/06/13メディア: 単行本購入: 5人 クリック: 44回この商品を含むブログ (3件) を見る 第0章…

代数統計学 algebraic statistics

代数統計学という分野があるそうだ こちらで次のように書かれている 「近年の統計学の発展はめざましい. その原動力は計算機の性能の大幅かつ急速な進歩である. それによって統計学の方法は一新され, 適用範囲も広がった. 一方, 大量の計算が必要なため, か…

実験計画法メモ2

1元配置 # 1元配置 Ng<-5 Ns<-sample(5:10,Ng,replace=TRUE) Fs<-c() for(i in 1:Ng){ Fs<-c(Fs,rep(i,Ns[i])) } Vs<-rnorm(sum(Ns)) D<-cbind(Fs,Vs) print(D) plot(Vs ~ Fs) myfit <- lm(Vs ~ Fs) anova(myfit) 2元配置 各水準の繰返し数によって「分散の…

実験計画法メモ

実験計画法入門byNAG フィッシャーによる実験計画法 実験計画法では研究を2つに分ける 計画性を持ってデータを集まる段階 集めたデータを解析する段階 実験計画立案時のポイント 目的の確認(目的を表す数値である『特性値』を定める) 因子の選定(因子として…

実験計画法

Association schemesは元々、実験計画法(Wiki)の「要因」のコントロールの配置の仕方から来ている話題 その教科書を2冊 入門 実験計画法作者: 永田靖出版社/メーカー: 日科技連出版社発売日: 2000/06/01メディア: 単行本購入: 8人 クリック: 160回この商品…

Association schemes

こちらの続き Latin squareが作るAssociation schemeの行列表現を作ってみる ラテン方格は『n 行 n 列の表に n 個の異なる記号を、各記号が各行および各列に1回だけ現れるように並べたもの』 今、個の要素について、そのペアをとって関係を考える 「自身」と…

Association schemes

Association Schemes: Designed Experiments, Algebra and Combinatorics (Cambridge Studies in Advanced Mathematics)作者: R. A. Bailey出版社/メーカー: Cambridge University Press発売日: 2004/02/26メディア: ハードカバー クリック: 1回この商品を含…

構造・演算規則

親族の基本構造作者: クロード・レヴィ=ストロース,福井和美出版社/メーカー: 青弓社発売日: 2001/01メディア: 単行本購入: 1人 クリック: 17回この商品を含むブログ (20件) を見る この本は大部な本である 親族の構造とそれを群でとらえることについては、…

駆け足で読む『確率論と私』

確率論と私作者: 伊藤清出版社/メーカー: 岩波書店発売日: 2010/09/15メディア: 単行本購入: 4人 クリック: 65回この商品を含むブログ (15件) を見る I 忘れられない言葉 忘れられない言葉 「哲学とは宇宙の原理、原則を研究する学問なり」 数学の研究を始め…

文化人類学と群

数学と文化人類学の邂逅(資料1) ムルンギン体系(資料2) 親族の基本構造作者: クロード・レヴィ=ストロース,福井和美出版社/メーカー: 青弓社発売日: 2001/01メディア: 単行本購入: 1人 クリック: 17回この商品を含むブログ (20件) を見る

駆け足で読む『群と表現』〜抽出する

群と表現 (理工系の基礎数学 9)作者: 吉川圭二出版社/メーカー: 岩波書店発売日: 1996/10/18メディア: 単行本購入: 2人 クリック: 7回この商品を含むブログ (6件) を見る 序を読む 生物の仕組みを考えるとき、入り組んでいて面倒くさい 入り組んでいることの…

平成23年度前期初学者用

平成23年度の初学者用ペーシングテキストはこれにしよう Applied Statistical Genetics with R: For Population-based Association Studies (Use R!)作者: Andrea S. Foulkes出版社/メーカー: Springer New York発売日: 2009/05/06メディア: ペーパーバック…

輪読の仕方を手ほどきする

教科書を読むことは非常に勉強になる Essential Cell Biology作者: Bruce Alberts,Dennis Bray,Karen Hopkin,Alexander D Johnson,Alexander Johnson,Julian Lewis,Martin Raff,Keith Roberts,Peter Walter出版社/メーカー: Garland Science発売日: 2009/04/…

駆け足で読む『カオス時系列解析の基礎』

時系列データについて、一通り考えたので、そろそろ本を読もう カオス時系列解析の基礎と応用池口 徹,小室 元政,山田 泰司産業図書発売日:2000-11ブクログでレビューを見る»カオスを想定した時系列データの解析方法の背景知識を得るための好著。大切な定理…

ぱらぱらめくる『状態空間時系列分析入門』

状態空間時系列分析入門J.J.F. コマンダー,S.J. クープマンシーエーピー出版発売日:2008-09ブクログでレビューを見る»時系列データの解析について、ゼロからスタートするときによし。簡潔。個人的に求めていた「状態空間」が少し複雑だったので、個人の評価…

駆け足で読む『偏微分方程式』(スタンリー・ファーロウ)

偏微分方程式―科学者・技術者のための使い方と解き方作者: スタンリーファーロウ,Stanley J. Farlow,伊理正夫,伊理由美出版社/メーカー: 朝倉書店発売日: 1996/12/01メディア: 単行本購入: 4人 クリック: 46回この商品を含むブログ (4件) を見る 第1部 入門…

数年がかりで

統計遺伝学の基礎と統計遺伝学以外の数理医学生物学への地ならしを数年がかりでやるとしたらどうするだろうか 教科書の選りすぐり。そしてその順序 - 医学科を卒業するときに、数理解析を念頭においた医学生物学を行う素地を作っておくために、計画を立てる…

駆け足で読む『曲線とソリトン』その2

こちらの続き 曲線とソリトン (開かれた数学)作者: 井ノ口順一出版社/メーカー: 朝倉書店発売日: 2010/03/01メディア: 単行本 クリック: 9回この商品を含むブログ (3件) を見る 7. 進行波解の定める曲線 曲線は曲率で決まる 取り扱いやすい曲線は曲率の微分…

駆け足で読む『曲線とソリトン』

曲線とソリトン (開かれた数学)作者: 井ノ口順一出版社/メーカー: 朝倉書店発売日: 2010/03/01メディア: 単行本 クリック: 9回この商品を含むブログ (3件) を見る 目次 1. 平面曲線 2. フレネの公式 3. 曲線の表現公式 4. 楕円関数 5. 平面曲線の時間発展 6.…

生き物らしさ

粘菌―驚くべき生命力の謎作者: 松本淳,伊沢正名出版社/メーカー: 誠文堂新光社発売日: 2007/04メディア: 大型本購入: 3人 クリック: 61回この商品を含むブログ (24件) を見る 写真が美しく、誠文堂新光社さんらしい本 粘菌の一生 胞子 粘菌アメーバ←→鞭毛細…

遺伝解析 ドライ入門

少し古いけれど、目次が参考になる。 Bioinformatics for Geneticists: A Bioinformatics Primer for the Analysis of Genetic Data作者: Michael R. Barnes出版社/メーカー: Wiley発売日: 2007/04/16メディア: ハードカバー クリック: 4回この商品を含むブ…

駆け足で読む『確率論的リスク解析の数理と方法』

疾患のモデル化をしている(こちら) 確率過程も別途行っている(こちらとこちら) 以下の本は、確率過程をリスク過程で実施するために利用可能な、利用されている事項が手際よく順を追って紹介されている(ようだ、まだ本を開いてめくっただけなので…)。 確率論…