Linking DNA methylation and histone modification: patterns and paradigms. H Cedar & Y Bergman nat reviews genet e-pub 24 Mar 2009 doi 10.1038 発生初期のde novo methylation Bimodal(２相性) methylation 多段階methlation Pluripotencyの喪失 rep…

Stochastic modelling for quantitative description of heterogeneous biological systems. DJ Wilkinson nat reviews genet 10:122-133 2009 システムバイオロジーで、多数の遺伝子の相互作用の帰結であるデータから情報抽出する場合 Stochastic model と …

Human genetic variation and its contribution to complex traits. KA Frazer et al. nat reviews genet 10:241-251 2009 Classes of human genetic variants Single nuclectide variant Insertion-deletion variant Block substitution Inversion variant …

いくつかの手法を比較している論文「Logistic regression protects against population structure in genetic association studies」by E. Setakis, H. Stirnadel and D.J. Balding はこちら 比較している手法は Armitage's trend test Genomic control Step…

Population Structure and Eigenanalysis by Nick Patterson, Alkes L. Price and David Reich PLos Genetics (2006) 2 e190 文献はこちら 人数m x SNP数nのジェノタイプデータがあるとする。 データを標準化する 人数m x 人数mの情報にして その主成分分析…