多数のomeデータベースの今後

• Genotype-phenotype databases: challenges and solutions for the post-genomic era. GA Thorisson et al. nat reviews genet 10:9-18 2009
• 数多くのデータベースが存在しているが、今後はそれらを横断的につなぐ必要が出る。そのことについての現状概観と今後の動向に関するレビュー
• 従来型のデータベースはcentralized database（中央集権型）
• 今後は複数の核となるデータベースが、相当程度の役割を持ちつつ、それらが相互連結された連合型のデータベース federated database
  • データのハンドリングの諸段階は双方向性の関係を。
    • Data production
    • Data packaging and release
    • Data deposition into the WWW
    • Data aggregation or federation
    • Data search and finding fruits
  • 必要なこと
    • Syntax(構文)とSemantics(解釈する(される)意味・プログラムの動作)の標準化
    • Object (data elements) model
    • Exchange format
    • Ontology
    • Globally-unique identifier
    • Web service
• たとえば、caGrid