- 勉強会の関連話題(こちら)でGFFフォーマットのことが出た。
- Sequence ontology:The Sequence Ontology, or SO, is an ontology suitable for describing biological sequences (Wikipedia)
- GFFフォーマット:こちら
- GFF3フォーマット:こちら-GVFフォーマット:こちら
- R(Bioconductor)でgff(3)フォーマット:genomeIntervalsパッケージ
- 2書式
- XML
- タブ区切りテキスト
- GFF3はタブ区切りテキスト
- GVFはGFF3のこの利点を継承
- ゲノム領域のオントロジー情報と多様性・多型情報を把持
- GVF_examples(1)
- GVF_examples(2)
- GVF_examples(3)
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