パパッとメモしたいことはよくある。 コピーした裏紙に描いたりするけれど、電子文書生活が続くと、結局、いつのまにやらゴミ箱へ行くことになる。 そこで、さらさらっ、がどのくらい使いやすいかをはてなのお絵かき機能で試してみる。ささっと描きたいので…

サイトはこちらHigh risk allele frequency (A) : (0 - 1) リスクアレル頻度 Prevalence : (0.0001 - 0.9999) 疾患の集団中有病率 Genotype relative risk Aa : ( >1 ) ヘテロのＲＲ Genotype relative risk AA : ( >1 ) ホモのＲＲ(>1とありますが、１を入…

観測データの分布の具合を知るのに、分位点を求めることがある。この関数はquantile関数。 今、valuesが観測データの値のリストとし、知りたい分位点のリストをlist={0,25,0.5,0.75}のようにすれば、 quantile(values,list)のようにして、分位点にある観測デ…

今、ある集団でSNPの３ジェノタイプの頻度がgen={g1,g2,g3}であり、あるフェノタイプの有病率がprevであり、３ジェノタイプの相対危険度がweight={w1,w2,w3}であるとすると、ケース群とコントロール群のジェノタイプ頻度は次のソースで得られる。これは、エ…

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目次類 R による統計処理 ３２０ページに及ぶPDF

コンピュータによる数値計算における精度のこと。 浮動小数点のことなどあり、計算結果に誤差が出る話し。Mathematicaを用いて計算していたところ、任意精度という概念を採用していることはこちらに書いた。Mathematicaはを『１を３等分したもの』という形で…