Jonckheere-Terpstra

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2つの軸がある 2カテゴリ 3以上カテゴリ・順序なし 3以上カテゴリ・順序あり 量的・順序あり 2カテゴリ ピアソン ピアソン 傾向性検定 線形回帰・順位和 3以上カテゴリ・順序なし - ピアソン Kruskal-Wallis Kruskal-Wallis 3以上カテゴリ・順序あり …

検定各論

SNP,CNPによらず、ジェノタイプ一般のこと 質的形質・量的形質によらず、形質一般のこと すべての場合に通じること ジェノタイプとフェノタイプとの間の関連・相関を調べる ジェノタイプは、カテゴリカルデータである ジェノタイプカテゴリに順序を考慮しな…

2x3分割表のKruskal-Wallis,Jonckheere-Terpstraの挙動

ここ数日の記事にて、形質に3タイプ以上の順位カテゴリや、量的形質を持ってきたときにKruskal-Wallis(3ジェノタイプに順序を考慮せず)と、Jonckheere-Terpstra(3ジェノタイプに順序を考慮する)とを適用することを書いてきた。今、ケースコントロール2x…

Jonckheere-Terpstra

import java.io.IOException; public class Jonckheere { int nGroup; int nRecord; int[] nRecPerGroup; double[][] data; //double[][] rank; double T; //double Tinv; double p; //double pinv; /** * @param args */ public static void main(String[] …

Jonckheere-Terpstra

Jonckheere-Terpstraでは、観測グループに順序を持ち込む。 そのためにk個のサンプルグループが作るペア()について、次のようにランクに基づく量,を算出し、それを全ペアについての総和をとる。 は、群の観測値について、群の個々の観測値のうち、a個につい…

ケースコントロール関連以外でパーミュテーションテスト

こちらのレビュー(Crit Care. 2004; 8(3): 196–199.)が簡潔にまとまっている。 Statistics review 10: Further nonparametric methods ちなみにこのレビューシリーズは、全14回(継続中?) このシリーズ1−14回へのリンクはこちら。 データ SNPのジェノタイ…