2008-05-01から1ヶ月間の記事一覧

2次元のヒストグラム

今、ある値のペアのデータがあるとする。{{x1,y1},{x2,y2},...,{xn,yn}}。 これを、xについて、ある刻みで、yについてもある刻みで、a(j) public static void main(String[] args) { // TODO 自動生成されたメソッド・スタブ int N=100; double[][] data=new…

ひたすらメモ(自分用)2

2x2 分割表 x y | p z w | q - a b | 1 p+q=1,a+b=1この比率でサンプル総数がN chi^2=Nr^2/(pqab); |r|=|x-ap|=|y-bp|=|z-aq|=|w-bq|正規化 1回目 x' y' | p z' w' | q - 1/2 1/2 | 1 p+q=1 chi^2=N(r')^2/(pq*1/2*1/2); |r'|=|x'-p/2|=|y'-p/2|=|z'-q/2|=|…

ひたすらメモ(自分用)

case:p,control:q, p+q=1; exp={pa,pb,pc,qa,qb,qc} any observation = exp: Table spaces are the overlap of two regular triangle, that are mutually homethetic and that are placed in the point symmetry except for the size at the exp point.

線分データの数え上げ(続きの続きの続き)

前の記事はこちら 今、N個のデータが得られるとする。そのデータは、1次元尺度上の線分に相当するデータであるものとする。簡単に言えば、aiからbiまでというようなデータが、N個得られるとする。このようなデータから、ある値xについて、[tex:ai test<-fun…

線分データの数え上げ(続きの続き)

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線分データの数え上げ(続き)

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線分データの数え上げ

今、N個のデータが得られるとする。そのデータは、1次元尺度上の線分に相当するデータであるものとする。簡単に言えば、aiからbiまでというようなデータが、N個得られるとする。このようなデータから、ある値xについて、[tex:ai package binaryTree; /** * …

メモ

f

2x3表がある ケースN人、コントロールM人、合わせてT人 ケース・コントロールを合わせた、SNPの3ジェノタイプカウントが、a+b+c=Tとする 合算のアレル頻度がr=(a+b/2)/T、、HWE下で期待されるヘテロの数がbe=2Tr(1-r) f=1-b/be 今、ケースとコントロール…

MHC領域

リンク 遺伝子ベースでの、セントロメア側の端はTAP binding protein (tapasin) GeneID: 6892 テロメア側の端は HFE (hemochromatosis) GeneID: 3077 それぞれ、NCBIのページにリンクを張ったが、ゲノム塩基配列からNC_000006.10 上にあり、tapasin はそこの…

遺伝統計学・統計遺伝学の目で京都大学のシラバスを眺めてみる

主に平成19年度。ウェブからアクセスできるもの(学内のみかも…) 学部・学系の大きいところ(農学・工学)は、カリキュラムが広い。 農学部・農学研究科 学部 遺伝学 遺伝学II 育種学I 育種学II 応用動物遺伝学 植物遺伝資源学 生物統計学 動物遺伝育種学 農学…

碁盤

□一二三四五六 01┌┬┬┬┬┐ 02├┼┼┼┼┤ 03├┼┼┼┼┤ 04├●●○┼┤ 05├┼┼●○┤ 06└┴┴┴┴┘ ハマ ●=0、○=0 □一二三四五六七八九 01┌┬┬┬┬┬┬┬┐ 02├┼┼┼┼┼┼┼┤ 03├┼┼┼┼●○┼┤ 04├┼┼┼┼●○┼┤ 05├┼○┼┼┼●●┤ 06├┼┼┼┼┼┼┼┤ 07├┼┼○┼┼┼┼┤ 08├┼┼┼┼┼┼┼┤ 09└┴┴┴┴┴┴┴┘ ハマ ●=0、○=0 □一二三…

二人零和有限確定完全情報ゲーム

Wikipediaの記事

Smart Game Format

囲碁・オセロなどの対戦ゲームでは、交互に「イベント」があり、それによって、「状態」が変化する。この過程を履歴として残したものが、棋譜である。これをアプリケーションで用いるときのフォーマットのひとつがSGFである。 「木」構造をとっているという…

攪乱順列

N個のものが並んでいる。それを取り出して、並べ替えて、戻したときに、N個のいずれも元の位置に戻らないような順列が攪乱順列であり、そのような順列が、全順列に占める割合はに極めて早く収束する。 エクセルはこちら