スライドはこちら RFUシグナル強度と正規・対数正規・ポアソン対数正規・二項分布: ノイズとシグナル、ホモとヘテロ作者: ryamada発売日: 2015/05/07メディア: Kindle版この商品を含むブログ (1件) を見る スライドの図表作成のためのRmd。スライドはデータ…

昨日の記事や一昨日の記事に対数正規分布・ポアソン対数正規分布のことをメモした 常染色体上のSTRをPCR増幅をかませた実験によってピークシグナル型データを取得し、それに基づいてDNA型タイピングをするやり方がある そのデータについて、対数正規分布・ポ…

昨日、対数正規分布についてメモした その離散版。ポアソン対数正規分布 こちらのqRT-PCRとか、こちらの細菌検出とかで使われている ポアソン分布のパラメタが対数正規分布に従っているとして計算しているらしい poilogなるパッケージがあって、dpoilog(),rp…

対数正規分布は、supportが正の値をとる連続分布で、生命現象を含む自然現象に広くみられる分布(こちらのFacultyOf1000 Prime)にもあるように Rの対数正規分布に関する関数はdlnorm(),plnorm(),qlnorm(),rlnorm()の一式なのだが、ちょっと使いづらいかもしれ…

対数正規分布の場合。期待値がMean=1のとき、２つのパラメタの関係は Mean <- 1 x <- seq(from=0,to=5,length=100) s <- seq(from=0,to=2,length=11) s <- s[-1] m <- log(Mean)-s^2/2 X <- matrix(0,length(m),length(x)) R <- matrix(0,length(m),10000) f…

多くの量的臨床マーカーは、下限値を持つ。下限値を持たないものを挙げることが難しいくらい たくさんの標本で観察すると、正規分布に似ることが多いが、正規分布は下限値がない また、生命現象では、対数正規分布になりがちであることも経験的に(理論もある…