2015-08-01から1ヶ月間の記事一覧

Markov chain and sequential importance sampling インポータンス・サンプリング

空間をマルコフチェイン移動していく

Resampling sequential importance sampling インポータンス・サンプリング

多変数に独立に値を与えるといつまでたっても、スカスカ、なので、リサンプリングを導入することで、それなりに「密度を高く」する(?)

Annealed importance sampling インポータンス・サンプリング

だんだんサンプリングする分布を狭めていく

Sequential importance sampling インポータンス・サンプリング

複数の確立変数があるとき、1変数とその他変数に分けてそのうえで乱数発生する

Adaptive importance sampling インポータンス・サンプリング

p(x)は多変量正規分布とみなせる場合がある そうみなしてよいのなら、それを規定するパラメタをうまくとればよい

インポータンス・サンプリングの基礎

あるドメインに生起確率分布があるとする そのドメインに、値があるとして、生起確率を考慮した期待値の推定をする このとき、モンテカルロで推定するとする どこもかしこも均一にランダム発生して値を計算してその平均をとるより 値確認をする頻度にバラツ…

インポータンス・サンプリング

こちらでモンテカルロ・シミュレーションについてメモした その中で重要になるのがインポータンス・サンプリング ネタPDF 構成 インポータンスサンプリングの基礎 Adaptive importance samplin Sequential importance sampling Annealed importance sampling…

遺伝率推定とMxとMixed Linear Model

遺伝率とその推定のためのACEモデル・アプリケーション"Mx" MxはStructural Equation Model Mixed Linear Model いずれにしろ、次のようなことが基本になる 表現型の分散共分散行列が、のように分解できて、この分散共分散行列に従う多次元正規分布の点(多次…

トレンド正確確率検定

2x3のSNP関連テーブルがあるとき、帰無仮説に基づいて、その正確生起確率を計算することは可能(周辺度数が与えられたときに置きうるすべてのテーブルについて) 起きうるすべてのテーブルについて、その生起確率の大小によって順序を定め、「観測テーブルと同…