Ewens sampling formula

Ewens sampling formula

Ewens sampling formulaは、集団のハプロタイプ生成状況にある条件を課したときに、標本の頻度分布の正確確率に関する式 これは集団遺伝学の領域では、最も単純な条件でのCoalescent過程が生成する頻度分布になる Coalescent過程は頻度分布のみを定めるだけ…

Ewens sampling formulaを遺伝現象的に説明し直す

Ewens sampling formulaは以下の式で表され、 [tex:Pr*1=\frac{n!\theta^k}{\theta^{\[n\]}}\prod_{i=1}^n \frac{1}{i^{m_i}m_i!}], このような式であらわされるような突然変異の係数について、サンプル数nのときの、異なるアレルの数の期待値は[tex:\sum le…

分割の個数を出す

Ewens sampling formulaについて数日前に書いた。それは、ある正の整数を正の整数の和で表す表し方と関係していることも書いた。 このように整数を整数の和で表すことを整数分割という。それについては、こちらを参照。 その整数分割のパターン数をJavaでべ…