教科書
Causal Inference for Statistics, Social, and Biomedical Sciences: An Introduction作者: Guido W. Imbens,Donald B. Rubin出版社/メーカー: Cambridge University Press発売日: 2015/04/06メディア: ハードカバーこの商品を含むブログを見る 目次 Part I…
割り付けがどうなされているか・観察データの得られ方がどうなっているかによって、スタディを分類し、それぞれに対する手法があるので、それについての説明になっている 分類と帰属手法名とを目次を見て列挙するとよいだろう Part II Randomized Assignment…
1 Causality: The Basic Framework 2 A Brief History of the Potential Outcomes Approach to Causal Inference 3 A Classification of Assignment Mechanisms この本で扱う"Causality"について定義 "Potential Outcomes" Approach と言うのがこの本の肝 割…
2014年度講義資料 FDRとマルチプルテスティング 90分で1-2回分相当 Rmdファイルです。html化、epub化できます(やり方はこちら) html化、epub化が面倒くさければ、kindleで1米ドルでも(こちら) マルチプルテスティングとFDR?オミックス統計学2014_4? 統計遺伝…
ひとまず、次世代データ、Deep sequencing データの資料はこんなもの 「こうすれば、よい」という段階ではないので、コンセプト説明が重くなり、また、いざというときの汎用性重視になった…結局、「入門」としては役に立てにくいのだが… まだ、1度も講義使用…
こちらの続き SNPのケースコントロール分割表のための配布資料 これで90分１回分か2回分と予想 以下はRmdフォーマット。knitrするとhtml化、epub化できます(もちろんフリー)→こちら) その手間を惜しむ人向けにKindleサイトを利用中(こちらにほどなく現れる予…
京都大学大学院医学研究科の修士対象講義は、2012年度に「インフォマティクス」2013年度に「統計学処理の基礎概念」を扱っています。2014年度は、遺伝疫学やオミックスデータ解析の論文の主張を読み取ったり、それを臨床展開することを念頭に置いた「解析初…
こちら そのAppendixの構成がいい 英単語の復習の意味も込めて Appendix B Mathematical Formulae and Results B.1 Numbers and Intervals (数と区間) Real numbers 実数 Integers 整数 Positive integers, Natural numbers 自然数 Non-negative integers 非…
Likelihood, Bayesian, and MCMC Methods in Quantitative Genetics (Statistics for Biology and Health)作者: Daniel Sorensen,Daniel Gianola出版社/メーカー: Springer発売日: 2002/08/12メディア: ハードカバー クリック: 12回この商品を含むブログを見…
Mathematical and Statistical Methods for Genetic Analysis (Statistics for Biology and Health)作者: Kenneth Lange出版社/メーカー: Springer発売日: 2002/03/28メディア: ハードカバー購入: 1人 クリック: 6回この商品を含むブログを見る 少し古いけれ…
Nonuniform Sampling: Theory and Practice (Information Technology: Transmission, Processing and Storage)作者: Farokh Marvasti出版社/メーカー: Springer発売日: 2001/11/30メディア: ハードカバー クリック: 5回この商品を含むブログ (2件) を見る ひ…
"Sparse"(疎), "nonuniform"(不均等) Multi-dimensional sparse time series: feature extraction Feature Extraction Statistical Inference Methods for Sparse Biological Time Series Data Sparse spectral-line estimation for nonuniformly sampled mu…
品種改良の世界史・作物編作者: 鵜飼保雄,大澤良出版社/メーカー: 悠書館発売日: 2010/12/16メディア: 単行本 クリック: 8回この商品を含むブログ (1件) を見る品種改良の世界史 家畜編作者: 正田陽一,松川正,伊藤晃,楠瀬良,三上仁志,角田健司,田名部雄一出…
データがあったときに、そこに何を見るか。この点に関して複数の人の間で共有しようというのが、データの解釈・データマイニング。 それを『統計』と言うことも。 『統計は難しい』と言うとき、２つの難しさがあるのかもしれない。 （１）データがあって、そ…
血液・免疫系(主要クラス数>30) Megakaryocyte(2種、megakaryocyte, 血小板) 赤血球(1種) 幹細胞(前駆細胞)(いろいろ,造血幹細胞) リンパ球(>10)(B,T,NK...) 単球・マクロファージ(>6) 樹状細胞(>4) (血中)顆粒球(3,好中球、好酸球、好塩基球) マスト細胞 線…
Human Molecular Genetics作者: Tom Strachan,Andrew Read出版社/メーカー: Garland Science発売日: 2010/04/22メディア: ペーパーバック クリック: 6回この商品を含むブログ (2件) を見る 見開きに"Quick Reference"がある それを「ざっと」読むと、「生物…
Saccharomyces cerevisiae 線虫 ショウジョウバエ zebrafish マウス
cat cow,sheep,pig dog mouse rat chimpanzee marmoset rhesus macaque
zebrafish medaka xenopus chick mouse rat
線虫 ショウジョウバエ
E.coli Saccharomyces cerevisiae Schizosaccharomyces pombe Chlamydomonas reinhardtii Dictyostelium discoideum Tetrahymena thermophila
酵母 線虫 ショウジョウバエ zebrafish, メダカ マウス
Nonhuman primates Other mammals Other vertegrates Invertebrates
Invertebrates Roundworm Fruit fly Fish Zebrafish Frogs Large-grawed frog Small-clawed frog Birds chick Mammals mouse baboon
レファレンス(こちら)
dbSNP Human Genome Variation Society (こちら）
遺伝子名とアレルの命名(こちら)
数の異常 Triploidy 例 69,XXX, 69,XXY, 69,XYY Trisomy 例 47, XX,+21 Monosomy 例 45,X Mosaicism 例 47,XXX/46,XX 構造異常 Deletion Inversion Duplication Insertion Ring chromosome Marker Reciprocal translocation Robertsonian translocation
短腕p(petit)と長腕q(queue) バンドは中央から遠位へ こちら
Group A 1,2,3 最大、1 and 3 are metacentric, 2 is submetacentric Group B 4,5 大きい、submetacentric, p/q 腕長が大きく異なる Group C 6-12,X 中ぐらいの大きさ、submetacentric Group D 13-15 中ぐらいの大きさ、acrocentric with satellites Group E…
