GEEの記事を書いている(昨日) GEEの基礎には、一般化線形回帰を用いる 一般化線形回帰についてはこちらを 一般化線形回帰では、興味ある事象が、０か１かでもよいし、正規分布でもよいし、ポアッソン分布でもよい 興味ある事象(形質とそのフェノタイプ)の分…

今、prevalence=prev, リスクアレルホモの非リスクアレルホモに対する相対危険度がrであるとする 今、この着目SNP以外の要因が平均０、分散１の正規分布であるとする 閾値モデルで、閾値Tにて発病するとすると、Tとpの関係は、Rの関数を使えば、T=qnorm(p=1-…

複数のSNP型多型があり、それぞれ、0-1型形質のリスクを有するとする。 こちらの記事で示したように、各SNPのアレルには、アレル頻度に応じたリスクを持たせ、そのアレルに持たせたアレル特異的リスクの期待値は集団全体でゼロとなるように標準化するものと…