量的形質

1番

2つの選択肢があって、帰結が0/1であるときの決断方法について、ここなどで書いた 選択肢が[0,1]と連続値をとり、帰結も量的だとする ただし、選択肢の帰結は単純に平均と分散で決まる正規分布のようなものではなく、任意の分布であるとしよう たとえばこん…

1.Overview:駆け足で読む『Genetics and Analysis of Quantitative Traits』

適応・選択・淘汰 polygenic=multilocus 正規分布、平均と分散 ANOVA Fisher,Wright 育種、進化、人類遺伝学の融合 mediocrity(平凡、月並み)への回帰 atavism(先祖返り) 純系、交雑とフェノタイプのばらつき 表現型分散の分解 mutation,random genetic drif…

1.Properties of Distributions:駆け足で読む『Genetics and Analysis of Quantitative Traits』

Traits and their types Meristic characters Metric characters Binary characters Number of variables Univariate distribution Bivariate distribution (Paired) Multivariate distribution Marginal distribution of tables Univariate probability dis…

前書き:駆け足で読む『Genetics and Analysis of Quantitative Traits』

歴史 育種としての量的形質の遺伝学 動物学と植物学との垣根 理論部分と実践的・経験的部分 最近の発展、3点 進化生物学での活用 動物の育種における利用(人工授精化) ヒト遺伝因子解析QTL

駆け足で読む『Genetics and Analysis of Quantitative Traits』

Genetics and Analysis of Quantitative Traits作者: Michael Lynch,Bruce Walsh出版社/メーカー: Sinauer発売日: 1998/01/19メディア: ハードカバーこの商品を含むブログを見る こちらが本の「元サイト」 来月から始まるこちらの勉強会。勉強開始に先立ち、…

量的疾患の解析手法のメモ

複合遺伝性(疾患) 1ローカスによるメンデルの法則によって説明できず、複数の(通常は多数の)ローカスの影響によって決まる遺伝形質(疾患) 遺伝形質 量的形質 質的形質(疾病など) 多遺伝子性(Polygenic) 身長の遺伝子論文 Hundreds of variants clustered in…

Quantitative traits

Quantitative traitsのおさらい

同胞は親子よりも似ている

Covariance between relatives additive varianceは家系図的距離で効いてくる dominace varianceは家系図にループがあるときに効いてくる Full siblingsの場合、sib1->mother->sib2->father->sib1のループがある Double first cousinsの場合、cousin1(c1)->c…

R/qtl

ホームページはこちら Debianから日本語で紹介しているサイトはこちら 使用している論文はこちら Genetic architecture of mouse skin inflammation and tumour susceptibility Nature 458, 505-508 (26 March 2009) | doi:10.1038/nature07683; Received 7 …

線形回帰をエクセルで

量的形質と遺伝子マーカー(SNP)との間の関係を検定するとする。 以前、正規分布近似ができない場合として、Jonckheereに関する記事を書いた(こちら)。 今回は、正規分布近似ができるものとする。対数変換によって、正規分布近似が可能となる場合も含める。概…