論文は関節リウマチの重症度スコアとHLA-DRBB1ハプロタイプとの関係を報告したもの(こちら) フェノタイプ：ラーセンスコア(骨レントゲン写真を基にスコア化したもの)、骨erosionの有り無し２値、死亡、DAS28(治療反応性を定量するスコア)。さらにそれらの経…

こんな処理も データ例 > Orthodont Grouped Data: distance ~ age | Subject distance age Subject Sex Male 1 26.0 8 M01 Male 1 2 25.0 10 M01 Male 1 3 29.0 12 M01 Male 1 4 31.0 14 M01 Male 1 5 21.5 8 M02 Male 1 6 22.5 10 M02 Male 1 7 23.0 12 M0…

GEEの記事を書いている(昨日) GEEの基礎には、一般化線形回帰を用いる 一般化線形回帰についてはこちらを 一般化線形回帰では、興味ある事象が、０か１かでもよいし、正規分布でもよいし、ポアッソン分布でもよい 興味ある事象(形質とそのフェノタイプ)の分…

昨日の続き GEEは多変量回帰 回帰で用いる分布は、一般化線形回帰を用いることで正規分布のみならず、指定する分布を用いることができる gee()では、それはfamilyという引数で指定する その引数指定はgml() （一般化線形回帰関数)の場合と同じ なぜなら、gee…

関連記事はこちら Quasi-likelihood 参考PDFはこちら こちらも参考 Marginalized multilevel modelがGEEの話しでは出てくる Wikiはこちら このWikiを見るに、こういうこと ある「平均となる値」が一つあって、それに単変量正規分布に従うぶれを考える その正…

GEEについての部分だけ抜き書き generalized estimating equation (GEE) 参考資料(こちら) Wiki記事(こちら) SASに一部実装したものがあるらしい Rにふたつのパッケージ geepack gee 結構、疎な分割表で重宝

Joint Statistical Meeting 2010 @ Vancouverの講義(2010/08/02)(主なセッションはこちら) Analysis of Ordinal Categorical Data 種本 Analysis of Ordinal Categorical Data (Wiley Series in Probability and Statistics)作者: Alan Agresti出版社/メーカ…