マイクロアレイ

2012-09-03

p.adjust()関数を使う

マイクロアレイ R FDR

昨日の続きマイクロアレイデータをクラスタリングしたフェノタイプと検定して、FDR補正してみる # サンプル数 Ns <- 500 # マーカー数 Nm <- 1000 # サンプルのパターン数(群数) Ns.pt <- 10 # マーカーのパターン数(群数) Nm.pt <- 10 # サンプル・マーカ…

2012-09-01

サンプルのクラスタリングとマーカーのクラスタリング

マイクロアレイシミュレーションヒートマップ

沢山のマーカーについて沢山のサンプルで定量的データが取られるサンプルをマーカー次元の空間に配置すると、「のたくった雲」のようになるとする同様に、マーカーをサンプル次元の空間に配置すると、「のたくった雲」のようになるとするその心は、マーカ…

2012-03-26

周期的発現の検出

マイクロアレイ発現論文

PLoS ONE論文複数の方法の比較