組み合わせローカス
※ !!!複雑系の諸用語につき、相当、あやふやなので、おおいに誤りを含む可能性がある記事。覚書として、記すが今後の修正、おおいにありえる。 気象学者 E.N.Lorenzは、気象現象を3要因と時間の4因子でモデル化した。モデルは3つの連立微分方程式から…
参考文献 独立ローカスのペアリング ロジスティックリグレッション Neural networks(ロジスティックリグレッションの非線形化) Set association CPM (combinatoiral partitioning method) MDR (Multifactor dimensionality reduction) Recursive partitionin…
※一部文字化けしています データ管理1 アイテム (1)遺伝子 (2)ローカス (3)個人2 遺伝子 2-1 遺伝子の定義 DNAとして親から子へ伝達され、機能性分子(RNA、たんぱく質)の発現を通じて個体の生命現象に影響を与える因子。DNA塩基配列とその配列の由…
前提 大規模なSNPジェノタイプデータの蓄積とそれを用いた推定ハプロタイプに基づく解析が行われている データ解析の方向性 一般論 物理的に遠隔の複数ローカスのジェノタイプデータを取り扱うことが必須である ローカスのジェノタイプデータはハプロタイプ…
全遺伝子を解析したのだったら、「必ず、TRUEが含まれるという観点でP値を評価できる」
個々のローカス 個々のローカスの感受性寄与度は それ単独で観測することができる それ単独で機序を検討することができる 個々のローカスの感受性寄与度は 寄与するコンテクストを考慮して観測することができる 寄与するコンテクストを考慮して検討すること…