2019-09-01から1ヶ月間の記事一覧

ガウシアンカーネル、カーネル・トリック

カーネルトリックというのがある カーネル関数を使って、データの次元を上げてやり、上げた次元で簡単な処理(線形処理)をした結果を返すことで、データのオリジナルな次元空間での非線形な出力を得るような時に使うのだが、トリックなのは、上げた次元での…

ディリクレ過程混交正規分布様球面分布

球面に粗密がランダムな点を取りたい ディリクレ過程で定まる無限項の多項分布を想定し、個々の項に対応して球面正規分布様のそれを取る ただし、球面積分布様のそれ、とは、球面上の一様乱点を接点とする接面に、接点を中心とした2次元正規分布をとる。その…

疑似1細胞発現データを作る

複数の細胞からのデータがある 細胞数が分かっている リード数を細胞数に分けて、疑似1細胞発現データを作りたい sample()関数を使って疑似作成できることを示し # 検体数 N # ある遺伝子のNGSリード数が Mだった # m1 + ... + mN = M; mi >= 0となるような…