データベース

BioSample BioProjectとか

オミックス分類での集積 次世代シークエンサーのSRA(Sequence Read Archive) ゲノムもエピゲノムもRNAseqもこれに入る トランスクリプトームであって次世代シークエンサーでないデータ型はGEOとArrayExpressとDDBJ Omics Archive 別の切り口・使ったサンプル…

Archetype

openEHRのArchtypeについて openEHRの総本山のHP テンプレートのリストを見てみるにはこちらやこちら ダウンロードするにはこんなコマンド svn co http://www.openehr.org/svn/knowledge/ ただし、archetypeは、Assertion Definition Language(ADL)という言…

openEHR

欧州を中心とした電子カルテ主体の臨床データ共通仕様の話し open EHR Archetypeと呼ばれる、オブジェクトを部品とする Archetypeを基本としてそれを3階層で管理する Archetypeを束ねたTemplateを作る(これが、1人1診療単位を想定している) Templateを束ね…

臨床情報

臨床情報の標準化・データベース管理に関して、混沌とした現況を眺めてみる、その上で、どういう風に取り扱いたいか、その利点・欠点についての感覚を持つために調べてみる対象を雑多にメモしてみる 先日のメモも参照 データベース化には、大きく米国系とヨ…

医薬関係データベースのいろいろ

レセプト型データベース レセプトの集計 現況 JMDC Jamm Net 近くNational DB化 診療記録型データベース 電子カルテの統合 SS-MIXという仕様 MDV(一部医療機関のDB) 国際標準化への動き CDISC そのUMINの解説サイト

SQLと集合論

こんな文書が目についた。 『「間違いだらけのデータアクセス」から脱却するために』(こちら) …SQL文は純然たる数学の集合論として考えられたものであるから…