2009-01-01から1ヶ月間の記事一覧

正確生起確率

清書はこちら のテーブルがある は公式 今、このテーブルの独立性の検定のカイ自乗値がであるとしたとき、自由度で、あり、自由度のカイ自乗統計量の確率密度の値はと表される ここで、との比を考える 自由度のみに依存する項が出てきたら、どんどん、にまと…

第5部 第23章 Inferene, Simulation and Enumeration of GenealogiesHandbook of Statistical Genetics(5-23)

家系図のグラフ表現 一般的な家系図:カップルの間に横棒、そこから生まれる子に折れ線 Marriage node graph:カップルの成立にノードを与え、その「カップル」関係を作る2親と、その「カップル」関係から生まれる子をノードとして、エッジでつないだグラフ…

第5部 第22章 Mathematical models in populationgenetics Handbook of Statistical Genetics(5-22)

1座位、2アレルのモデル 2アレル: その第世代の頻度: 変異 Mutation の変異率: の変異率: 世代にてだったアレルは変異しなければ()そのまま、だったアレルは変異すれば()、となる であるから 特に、のとき ランダムな遺伝的浮動 Random genetic drift…

Handbook of Statistical Genetics

Handbook of Statistical Genetics作者: David J. Balding,Martin Bishop,Chris Cannings出版社/メーカー: Wiley-Interscience発売日: 2007/10/01メディア: ハードカバー クリック: 16回この商品を含むブログ (5件) を見る 駆け足で読むには、専門に近すぎる…

言葉で説明Fst Dst Gst Rstのこと

リンク

[]ランダムっぽく効率を追求する。ケシポンにて

ケシポンという事務用品を入手した。小さなアルファベットを規則的に並べて押すスタンプで、印字領域が広いことと、少しずらしてスタンプすることで、さらに印字領域を広くすることから、個人情報などを読み取れなくする用途に使うスタンプである リンクはこ…

兄弟(同胞)の遺伝子はどれくらい似ているか(3)

これの続き 前回までに、染色体が同長で組み換えがない場合、染色体の長さが不均等で組み換えがない場合について考えた。 組み換えを考慮しよう。 はじめに、染色体数が1で、組み換えがある場合を考える 同胞が共有する割合の期待値は これは、同胞のそれぞ…

兄弟(同胞)の遺伝子はどれくらい似ているか(2)

これの続き 組み換えを考慮する前に、染色体の長さが均等でない場合を考えよう 前回は、すべての染色体の長さが同じものと仮定した。 全部でk種類の染色体があり、なる長さの染色体とする 同胞がシェアする期待値は ただしはk種類の染色体の父母由来を0,1で…