2015-03-01から1ヶ月間の記事一覧

Actionable〜一つの考え方

こちらにActionableなデータ・データサマリーに関する記事がある 二つの立場からのActionabilityについて書いている データ解析者・データ解析結果を提示する人、という立場からのactionableデータの特徴 Trusted ; Based on credible data, generated in a …

遺伝情報の返却について

先日の記事でNGSデータから得られた情報の扱いについて書いたけれど、その姉妹編(今日の記事が本編化) ゲノム研究参加者への情報伝達について(The Clinical Sequencing Exploratory Research (CSER) Consortium and the Electronic Medical Records and Geno…

sQTL GLiMMPS

論文 背景モデルの説明PDF アプリのサイト 概要 NGSでデータを取ると、エクソンが抜けるか抜けないかについて、「抜けていないことが確実なリード(対象エクソンとその前後どちらかのエクソンとにまたがったリード)本数と、エクソンをスキップしたことが確実…

SNPでIBD〜MCMC_IBDfinderを使う

これがペイパー 個人のSNPフェーズ不明データから、個人ペアごとに処理してIBD範囲を推定する方法は多いが(Relate,PLINK,BEAGLE,GERMLINEとか(詳細は知らないのですが、MCMC_IBDfinderのペイパーの記載によれば、ということで))、MCMC_IBDfinderは3人以上い…