HapMap

トリオデータのハンドリング箇所

HapMap,Haploviewにてトリオ(CEUサンプル、YRIサンプル)のデータをハンドリングしている箇所は、オープンソースHaploviewの "edu.mit.wi.haploview"パッケージの"HaploData.java"クラス。 トリオ関係については、ソースにじか書きしてあって("edu.mit.wi.hap…

念のための基礎的確認事項のメモ

HapMapプロジェクトのページはこちら データのダウンロードはこちら LDのダウンロードファイルはこちら HapMap論文(2005年)はこちら LDデータをダウンロードして、使い始める前に、少しだけ、気になることを確認する ゲノム上SNPの間隔について アレル頻度5%…