Knockoff

FDR: Benjamini-Hockberg

昨日の記事はKnockoff 変数を用いたFDRの制御の話 FDRといえば、Benjamini-Hochbergもある これは、「ある閾値で変数の取捨選択をするとする」ときに、すべの変数が帰無仮説OK変数だったとした場合に、何個の変数がFalselyに帰無仮説を棄却するかの期待個…

Knockoff 変数

Knockoff 変数を使ったFDRについての概説記事はこちら 説明変数 Xがnxp行列(nサンプル、p個の説明変数)であるときに この形は2p個の変数の分散共分散行列になっており、Positive definite したがって、(対角行列)の取り方に制約がある その制約がある中で、…

Knockoff 変数によるFDR

資料はこれ(基本)とこれ(GWAS等への拡張) Rのパッケージはknockoffで、そのgithubがこちら 考え方の基本 FDRをしたい 多変量解析をしていて、いくつかの変量は従属変量に意味のある寄与があり、残りの変量は意味がない、というように振り分けたい その振り分…