メモ ここでの2012/05/30分(こちら)での話 多分、こう （１）実験系の順序を変えるとIntegrate rank統計量は変わるのでは？ → 変わります → 変わりますが、相関はあります → でも、Ｎ個の遺伝子に付与される統計量は(順序は変われど)だいたい同じような値が…

LIMITED INFORMATION GOODNESS-OF-FIT TESTING IN MULTIDIMENSIONAL CONTINGENCY TABLES 分割表の場合(こちら) Exact Conditional Tests for Hierarchical Models in Multidimensional Contingency Tables

# 塩基を数字で表す base<-1:4 # 塩基名を文字で表す base.name<-c("T","C","A","G") # アミノ酸を数字で表す # stop codonを21番とする aa<-1:21 # アミノ酸を文字で表す # stop codonは"X"とする aa.name<-c("F","L","S","Y","C","W","P","H","Q","R","I",…

こちら そのAppendixの構成がいい 英単語の復習の意味も込めて Appendix B Mathematical Formulae and Results B.1 Numbers and Intervals (数と区間) Real numbers 実数 Integers 整数 Positive integers, Natural numbers 自然数 Non-negative integers 非…

Likelihood, Bayesian, and MCMC Methods in Quantitative Genetics (Statistics for Biology and Health)作者: Daniel Sorensen,Daniel Gianola出版社/メーカー: Springer発売日: 2002/08/12メディア: ハードカバー クリック: 12回この商品を含むブログを見…

Mathematical and Statistical Methods for Genetic Analysis (Statistics for Biology and Health)作者: Kenneth Lange出版社/メーカー: Springer発売日: 2002/03/28メディア: ハードカバー購入: 1人 クリック: 6回この商品を含むブログを見る 少し古いけれ…

こちらのSGC(b):6.20120613のための作業時メモ 一般化線形回帰 参考 VGAMパッケージ vglm()のR実施例 参考

ニコニコ動画というものがある テレビみたいなものとも言える 不特定な相手とのコミュニケーションのツールであり、マスコミ的な側面もあれば、ミニコミ的な側面もある ニコ動で講義を公開しているものはどれくらいあるのだろうと検索してみる と、それほど…

Levy過程が数学セミナーの2012年6月号で扱われている Levyと言えば、レヴィ飛行についてはこちらに少しだけ書いた 少し整理しよう 参考にした資料1 参考にした資料2 整理した上で、確率過程と生物学（遺伝統計学）との関係についても考えてみることにする Le…

法数学勉強会というものがある(こちら) こちらで勉強させていただきながら、統計遺伝学分野からのインプットをしているが、話題がたこ足状態になっているので、こちらで予定している総括を前に整理する 俯瞰図はこちら

こちらで急患の大まかな判断をしている 救急搬送 AND 胸痛における急性心筋梗塞という診断を扱っている 救急搬送という情報 「胸痛」という情報 心電図変化から読み取る、ある一つのカテゴリ情報 ST上昇/下降 ST上昇/下降は「ST上昇を伴う急性心筋梗塞」と「…

こちらのDNA多型学会のネタの整理をする 思いつくままに雑多に 情報を使って、判断する枠組みは、意識的にせよ無意識的にせよ、事前確率と事後確率とその計算関数(これに個人差があるだろう)とを使っているとする ただし、事前確率＋情報→事後確率、のパター…

N人の人のうち、ある１人が「○」で残りのN-1人が「×」の場合 N人の人のうち、k人が「○」で残りのN-k人が「×」の場合、ただしk=0,1,...,N 問題設定を少し変えよう N人のうち、i人が「○」で残りのN-i人が「×」の場合でiは特定の値とし、そのiについての和とし…

アレル数 naのとき、ディプロタイプ数は ディプロタイプ数 ng のとき、観察数は ng 総人数はN ここで、na個のアレルのアレル頻度を p1,,,pnaとして推定します。 ここから期待ディプロタイプ人数がng個の数として推定される。 観察数 ng があって、その内訳を…