2012-08-01から1ヶ月間の記事一覧

ぱらぱらめくる『ランダム グラフ ダイナミクス』

ディリクレ分布とカイ自乗分布とその歪み

総数を固定しなくても… メモ は (スターリングの公式)より であって に注意したり、,に注意したりして変形すると この式の移行関係には、対数尤度比がカイ自乗分布に従うという話がある k <- 5 library(MCMCpack) f <- c(rdirichlet(1,runif(k))) N <- 10000…

メモ

2項分布の連続化:β分布 多項分布の連続化:ディリクレ分布 確率ベクトル、観測度数, 確率 に制約をつけつつ、確率を最大にするようなが知りたいとする Rのoptim()関数で最適化することにする 少し普通ではない変数の置き方をする 長さのベクトルを考える …

正単体、多項分布、ディリクレ分布、最適化

3分布

3つの多次元分布がある X,Y,Zとする 標本がたくさんあって、X,Y,Zが形成されるが、標本は3分布を横串で貫いているのでX,Y,Zの間には何かしらの関係がありえる X,Yの関係とX,Zの関係は既知として、Y,Z間の関係があるのかないのかをデータから読み取りたいと…

交絡しながら分布を作る

3軸

カテゴリカルな尺度が3軸ある X,Y,Zの3つ XとYが関係し、XとZが関係している YとZはXとの関係とは独立にさらに関係しているのかどうか知りたい 3軸が作る3次元表が観察されたとする X,Yの2軸が作る2次元カテゴリの比率は偏りがあるが、そのままにして …

CAST, C-alpha test, SKAT

CAST cohort allelic sum test collapses information on all rare variants within a region C-alpha test non-burden-based method robust to the direction and magnitude of effect not easy to adjust for covariates, incl. population stratification…