2016-01-24から1日間の記事一覧

Single-cell RNA-seq解析を理解するためのメニュー

single-cell RNA-seq解析の手法論文を読むとき、何がハードルを上げているか、というと、「個別には理解できなくはないような、色々」を使って「総合芸術化」していることでしょうか いろいろな、データ処理のアイテムについて「この単語はだいたいこういう…

Single-cell RNA-seqの解析

Survey and Summary, Single-cell RNA-seq: advances and future challenges 資料1 Nature Reviews Genetics, Computational and analytical challenges in single-cell transcriptomics 資料2

バイアス・補正・正規化等の側面、データマイニングの側面:Single-cell RNA-seqの解析

Nature Reviews Genetics, Computational and analytical challenges in single-cell transcriptomics 資料2 定量標準を入れる UMI(Unique Molecular Identifilers):個々の分子をバーコード化し、増幅バイアス影響を排除した、「オリジナルの」分子数推定を…

検定・回帰の側面:Single-cell RNA-seqの解析

Survey and Summary, Single-cell RNA-seq: advances and future challenges 資料1 紙幅の多くは1細胞のRNAをきちんと回収し、きちんと読むこと、由来細胞をきちんと区別すること(バーコード・ラベル)など、リード産生プロセスに関すること Cell-to-cell v…