こちらの記事で死亡というフェノタイプから、「事件の蓄積」というフェノタイプを考えた このフェノタイプを整理する 生起確率が一定なイベントが複数回起きることで生じるフェノタイプとして定義した ここで用いるパラメタは: フェノタイプ成立に要する蓄積…

浸透率 発病する遺伝因子を有する個体のうち実際に発病する割合 こちらの記事で、「イベント累積型発病」の場合に、発病年齢が人生の後半になり、ヒトの寿命上限までに、十分にイベントが累積しないことがあるとこを示した 実際に浸透率を考える場合には、「…

0/1のフェノタイプ その１ 死亡というフェノタイプ その２ イベントの繰り返しというフェノタイプ その３ 浸透率 その４ 優性・劣性・その間 ３以上の順序ありカテゴリのフェノタイプ その５ 数えられるフェノタイプ、可逆・非可逆 その６ ステージ評価する…

ネットワークに介入する(薬物影響・遺伝影響)(ロトカ=ヴォルテラ編) library(sphere) library(rgl) StandardLotkaVolterra20111006<-function(n=4,inits=NULL,Nrep=30,drift=FALSE,driftk=0.05,Niter=1000,dt=0.01,us=NULL){ if(is.null(us)){ us<-rep(1,n) …

単一形質 タイプ カテゴリカル ２値 病気Xである・ない ３値以上 順序なし(構造なし) 状態0,1,2,3 構造あり 順序あり ステージ0/1/2/3 巡回0/1/2/3/0 複雑な構造(半順序やら、木構造やら) 量的 分布が扱いやすい 分布が扱いにくい 可逆・不可逆 (0->1),(01) …

こちらで関節リウマチのフェノタイプについて考えた こちらで精神疾患のそれを考えた こちらで皮膚科領域を考えている この論文はフェノタイプの比をとるという組み合わせを扱っている フェノタイプが時系列で相互作用する話は延々とこちらなどで扱っている …

皮膚科の診断は視覚所見の役割が大きい 視覚所見は解析に乗せるのが難しい観察項目の代表例 考える機会をいただいたのでそれについてレビューに基づいて考えてみる レビュー(こちら) 疾患フェノタイプの体系的構築における問題(の例) "Most diseases are buc…