Multiallelic D’
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Ｄ’は、２つのＳＮＰが作る４ハプロタイプの頻度のばらつき具合を表す数字で、 １がばらばら、０が均質、です(h1*h4-h2*h3)が０なら、ゼロ、これが大きい方 の極端なら１、です。 multiallelic D'も基本的には、０が「均質」１が「偏り」です。 今、1つ目のブロックに５つのハプロタイプがあり、２つ目のブロックに２つの ハプロタイプがあるとします。 もし、１つめのブロックに２つしかハプロタイプがなければ、１つめのブロック も２つめのブロックも２つずつのハプロタイプしかありませんから、 multiallelic D'は普通のＤ’と同じになります。 ですが、今、１つめのブロックには、２つのハプロタイプの代わりに５つのハプ ロタイプがありますから、ちょっと工夫が必要で 1つ目のブロックの５つのハプロタイプを、1個とそれ以外に分けてやります。そ うすると２つのブロックはそれぞれ２ハプロタイプのブロック同士に見なせるの で、普通のＤ’が定義できます。 このようにして、２つのブロックの間に仮に2ハプロタイプー２ハプロタイプの 組を作ってやって、それぞれのすべてについて、普通のＤ’を計算してやります。 それらを全部合せて、2ブロック間の関係を出したいわけです。 全部を足して、割ってやってもいいのですが、それだと、頻度が高いタイプの力 と頻度の低いタイプの力を平等に扱うことになって、不公平な感じもします。で すので、そこのところを、頻度が高いものは重く、低いものは軽くして、平均を とった(加重平均)ものがmultiallelic D'です。
