ベイズによるRJMCMC(reversible jump MCMC)

• Statistical genetics Fitting phenotypes. T Casci 9 2008
  • Predicting Unobserved phenotypes for complex traits from whole-genome SNP data. SH Lee et al. PLosS Genet 4:e1000231 2008
  • 帰無仮説を検定して多重検定に耐えうる統計的有意水準を得るという立場の困難はますます増大している。
  • それと別の立場がベイジアンン。
    • RJMCMC(解説こちら)はそのベイジアンのやり方の一つ。すでに、ゲノムワイドスタディへの適用も始まり、それより早く、組換え率推定への適用(こちら)もある。
    • 全マーカーを一塊で扱い、形質を予測できるマーカー(群)を探索する。
  • MCMCに使われるMatropolis-Hastings サンプラーは次元が固定されているときには使えるが、次元を不定にすると不都合。RJMCMCは不定な次元でMCMCを回せる。