ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ

2009-11-21

ＰＣＡの歪み

論文 PCA ARG

PLoS Geneticsの論文です。
A Genealogical Interpretation of Principal Components Analysis. by Gil McVean
non-parametricに次元圧縮をする手法であるPCA,SVDからの情報を使って、コアレセントモデルにあてはめて推定する話し
ＰＣＡとその親類であるSVD(Singular value decomposition)についてかいつまんで説明がされていて、よい。
ＰＣＡがサンプル数の影響を受けて、歪む様子を図にした図３もよい

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