2009-06-05から1日間の記事一覧

EigenstratでLD関係の調整

PCA

PCAを用いたEigenstratにより、サンプルの遠近関係を分析することがある。そのときに、LDが強いマーカーは、解析全体に影響を及ぼすので、強いLD関係にあるマーカーを組み込みすぎないようにするオプションがある。その方法を友人に教えてもらった src/eigen…