2012-09-03から1日間の記事一覧

FDR補正とFWER補正とを比較する

FWER法では、最小p値が補正後も有意になるかならかないかの程度だが、FDR法では、小さいp値をとっている検定のうちのある画分が、補正後も0-1の範囲に散らばり、その中には、有意になるものがあるんではないかい、というp値の分布になる # fdr法で補正する f…

p.adjust()関数を使う

昨日の続き マイクロアレイデータをクラスタリングした フェノタイプと検定して、FDR補正してみる # サンプル数 Ns <- 500 # マーカー数 Nm <- 1000 # サンプルのパターン数(群数) Ns.pt <- 10 # マーカーのパターン数(群数) Nm.pt <- 10 # サンプル・マーカ…