こちらはProbabilistic Programming Systemsに関する情報を集めたサイト データを使って推定をするためのプログラミングに関すること全般。モデル、アルゴリズム、実装、など 関係する用語 Approximate Bayesian Computation(ABC)(ベイズするのはベイズする…

User’s Guide and Reference Manual』 Stan_Modeling_Language_User's_Guide_and_Reference_Manual Part I イントロ 1. 概要 PartII Stan 言語 Stanを実行するためにhoge.stanをどうやって書くかに関するパート 2. データタイプと変数 パラメタを推定するた…

Rのbnlearnパッケージを使う ジェノタイプ推定で学ぶベイジアンネットワーク 法廷のためのベイジアンネットワーク その解説文書

Wikipedia英語版のテーブル(こちら)の日本語化したものを、Wikipedia砂場で作成 以下のそれは、Wikiフォーマット。砂場に入れれば表にして見られる {| class="wikitable" align="center" style="text-align:center; border:none; background:transparent;" |…

Tevfik DORAK's homepage その彼のよいサマリー まとめ方。上記を参考にして (どうしてそんなに複雑なのか？) HLA領域(extended MHC)の位置、大きさ 関連Phenotypes：免疫系、非免疫系 HLAの複雑さの特徴は何か？ 遺伝子の数、密度 その内訳：HLA,non-HLA ex…

こちら,こちら,こちら,こちらでやっていることのこと 観測値の標本平均値は これはを最小にする の解 実数直線にという距離の定義を入れ、そのWasserstein distanceの和を最小にするような ( ) 別の見方をすると、平均（分散はなんでもOK)なる正規分布からの…

シリーズの目次 KLダイバージェンス：遺伝統計学のための情報幾何５作者: ryamada発売日: 2017/03/07メディア: Kindle版この商品を含むブログ (1件) を見る 双対平坦空間では、拡張ピタゴラスの定理が成り立つので、斜辺を共有する直角三角形が、２つの円周(…

シリーズの目次 指数型分布族と双対座標系：統計遺伝学のための情報幾何4作者: ryamada発売日: 2017/03/05メディア: Kindle版この商品を含むブログ (1件) を見る --- title: "指数型分布族と双対座標系 Exponential Family and dual coordinate systems" aut…

シリーズの目次 双対平坦、双直交、双対座標系：遺伝統計学のための情報幾何3作者: ryamada発売日: 2017/03/04メディア: Kindle版この商品を含むブログ (1件) を見る --- title: "双対平坦・双直交 Dually flat, dually orthogonal" author: "ryamada" date:…

シリーズの目次 分布は点である: 統計遺伝学のための情報幾何１作者: ryamada発売日: 2017/03/04メディア: Kindle版この商品を含むブログ (1件) を見る --- title: "分布は点である Distributions are points" author: "ryamada" date: "2017年2月24日" outp…

具体例がないとわかりにくいので、具体例から入る 正規分布を座標系と座標系で表すことができる 座標系というのは、分布関数を指数族表現したときに現れるパラメタであって、正規分布の場合にはとなるようなそれである 具体的には 他方、座標系というのは、…

以下は、旧版 フィッシャー情報量: 統計遺伝学のための情報幾何２作者: ryamada発売日: 2017/02/24メディア: Kindle版この商品を含むブログ (1件) を見る --- title: "Fisher Information Matrix" author: "ryamada" date: "2017年2月25日" output: html_doc…

シリーズの目次 フィッシャー情報量の色々：遺伝統計学のための情報幾何２作者: ryamada発売日: 2017/03/04メディア: Kindle版この商品を含むブログ (1件) を見る pandocでメモリサイズを変える(こちら) 旧バージョンはこちら --- title: "Fisher Informatio…

シリーズの目次 この回は大改訂するかもしれません→正規テキストからはずれました 尤度関数・指数型分布族: 統計遺伝学のための情報幾何１作者: ryamada発売日: 2017/02/23メディア: Kindle版この商品を含むブログ (1件) を見る --- title: "尤度関数の空間 …

シリーズの目次 微分積分7 ヤコビ行列、座標変換作者: ryamada発売日: 2017/02/17メディア: Kindle版この商品を含むブログ (1件) を見る --- title: "Calculus7 Jacobian Matrix and Coordinate Transformation ヤコビ行列と座標変換" author: "ryamada" dat…

シリーズの目次 微分積分６テイラー展開、ボンフェロニ補正、積率母関数、ニュートン法作者: ryamada発売日: 2017/01/29メディア: Kindle版この商品を含むブログを見る --- title: "Calculus6 Taylor expansion テイラー展開" author: "ryamada" date: "2017…

シリーズの目次 微分積分５曲線と曲面作者: ryamada発売日: 2017/01/27メディア: Kindle版この商品を含むブログ (1件) を見る --- title: "Calculus5 曲線・曲面 Curved line and surface" author: "ryamada" date: "2017年1月22日" output: html_document: …

シリーズの目次 微分積分４多変量ベイズ推定のための偏微分作者: ryamada発売日: 2017/01/28メディア: Kindle版この商品を含むブログを見る --- title: "Calculus4 Partial differentiation" author: "ryamada" date: "2017年1月22日" output: html_document…

シリーズの目次 微分積分３確率密度関数・累積関数・ハザード関数作者: ryamada発売日: 2017/01/28メディア: Kindle版この商品を含むブログ (1件) を見る --- title: "Calculus3 Density, Cumulative, Hazard" author: "ryamada" date: "2017年1月22日" outp…

シリーズの目次 微分積分２尤度関数・最尤法・接線作者: ryamada発売日: 2017/01/28メディア: Kindle版この商品を含むブログを見る --- title: "Calculus2 Calculus for Likelihood Function and Maximum Likelihood Estimation " author: "ryamada" date: "…

シリーズの目次 微分積分１ 重み付き平均と期待値と積分作者: ryamada発売日: 2017/01/27メディア: Kindle版この商品を含むブログ (1件) を見る --- title: "Calculus1 Expected value and basics of differentiation and integration" author: "ryamada" da…