Alternative splicing機構とnonsense-mediated mRNA decay

• Alternative splicing in disease and therapy. Review by Mariano A Farcia-Blance, Andrew P Baraniak & Erika L Lasda, Nature Biotechnology 22 (2004) 535-546

Alternative splicing in disease and therapy - Nature Biotechnology

• Alternative splicingのタイプ
  
  • イントロンの抜け落ち
  • エクソン3'側のスプライス部位の違い(エクソン長の差を生じる)
  • エクソン5'側のスプライス部位の違い(エクソン長の差を生じる)
  • エクソン(1個もしくは2個以上)がそっくり脱落したり挿入したり
  • エクソンの個数は同じながら、選択されるエクソンが入れ替わる
  • 第1エクソンが異なる(転写開始点が異なる)
  • 最終エクソンが異なる
  • DNA上異なる部位にあるエクソンが取り込まれる
• スプライシングにおいて「エクソン部分」を認識する機構
  
  • ESE:Exonic splicing enhancer
  • ESS:Exonic splicing silencer
  • ISE:Intronic splicing enhancer
  • ISS:Intronic splicing silencer
• エクソン範囲を正確に切り出す機構
  
  • U2-dependent introns
  • U12-dependent introns
• 不良品mRNAの検出機構
  
  • Nonsense-mediated mRNA decay
    
    • Nonsense-medicate mRNA decay. Review by Lynne E Maquat, Current Biology 12 (2002) R196-R197
      
      • ScienceDirect - Current Biology : Nonsense-mediated mRNA decay