Rのhaplo.statsの使い方(8)haplo.scoreの概要



  • haplo.scoreの行うこと
    • ジェノタイプデータよりハプロタイプ推定を行う
    • 推定したハプロタイプとその他の因子(フェノタイプ・ハプロタイプと無関係のジェノタイプなど)との関連をスコア統計量を用いて検定する
    • 「その他の因子」はbinomial, ordinal, quantitative(正規分布・ポワソン分布)の4通りに適用できる
    • 因子による調整(層別化)を指定できる
    • シミュレーションベースのp値を得るように方法指定することもできる
  • スコア統計量・スコア検定について