Allele-sharing distance

表題の用語について質問を受けた。

集団間の遺伝的な距離を表す指標のひとつである。

今、ある多型ローカスがあったとき、２集団間にその多型ローカスの"Allele-sharing distance"が定義される。複数のローカスを用いて、"Allele-sharing distance"を定義するためには、個々のローカスの"Allele-sharing distance"の加算平均を用いる。

個々のローカスの"Allele-sharing distance"は次のように定義される。

今、Nアレルあるローカスとする。そのアレル頻度が{P1(1),P1(2),...,P1(N)}, {P(1),P2(2),...,P2(N)}とする。個々のアレルについて、小さい値をと記すとすると、をローカスiにおける"Allele-sharing distance"と定義する。

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